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La revue francophone de médecine générale
Rubrique: ACTUALITÉS
Auteurs: Pozzetto B, Bechri I, Delolme M, Vogrig M, Rigaill J, Verhoeven P, Bourlet T, Pillet S.
Citer cet article: Pozzetto B, Bechri I, Delolme M, Vogrig M, Rigaill J, Verhoeven P, Bourlet T, Pillet S. État des lieux du diagnostic virologique de l’infection à SARS-CoV-2. exercer 2020;163:215-20.
Lien URL: https://www.exercer.fr/full_article/1442
Cet article est en accès libre
Résumé
L’infection COVID-19 a émergé de façon soudaine en Chine, en décembre 2019 et est devenue rapidement pandémique. Le virus responsable a été identifié comme un nouveau coronavirus probablement issu d’un virus de chauve-souris, dénommé SARS-CoV-2, ce qui a permis de mettre au point des tests diagnostiques permettant l’identification de son ARN par techniques moléculaires. En plus du rappel de quelques données virologiques, l’objet de cette revue est de présenter les tests moléculaires de diagnostic direct et les tests sérologiques actuellement disponibles pour identifier cette infection. Le diagnostic repose principalement sur la détection du génome viral par RT-PCR en temps réel dans les sécrétions respiratoires (prélèvements nasopharyngés à la phase précoce et prélèvements respiratoires profonds au stade de pneumonie) ; les résultats sont disponibles dans un délai d’environ 4 heures. Le pic de l’infectiosité se situe entre le 3e jour avant et le 3e après le début des symptômes. Le virus peut également être détecté dans le sang et dans les selles, même si, à ce jour, l’infectiosité du virus dans ces prélèvements n’est pas avérée. A un stade plus tardif de l’infection,
une réponse humorale anti-SARS-CoV-2 peut être mise en évidence, avec des anticorps de classes IgM et IgA à partir du 8 ou 9e jour après le début des symptômes, puis des anticorps de classe IgG qui signent un contact antérieur avec cet agent. L’apparition des anticorps peut se faire très tardivement dans les formes pauci- ou asymptomatiques. De nombreuses questions sont encore non résolues, notamment en ce qui concerne le caractère protecteur de cette réponse humorale et sa durée, ainsi que son rôle dans la physiopathologie des formes sévères.
Summary
The COVID-19 infection has emerged suddenly in China, in December 2019, and spread rapidly worldwide. The virus responsible for this dramatic outbreak was soon identified as a new coronavirus derived from a bat virus that was named SARS-CoV-2, which allowed the design of molecular tests able to detect the viral RNA in clinical specimens. In addition to a few data on this new virus, the aim of this review is to present the molecular tests that are used for the direct detection of the viral genome and the serological tests that are available to characterize this infection. The diagnosis lays mainly on the recognition of the viral RNA by real-time RT-PCR in the respiratory secretions (naso-pharyngeal specimens at the early phase of infection and deep respiratory specimens at the stage of pneumonia); the results are available in approximately 4 hours of time. The peak of infectivity occurs between 3 days before and 3 days after the onset of symptoms. The viral RNA can also be detected in blood and stools but the infectivity of these samples has not been demonstrated yet. At a later stage of infection, an anti-SARS-CoV-2 humoral answer can be recorded, with IgM and IgA specific antibodies as soon as 8 or 9 days after the onset of symptoms; later, IgG specific antibodies sign an earlier contact with the virus. The detection of IgG antibodies may be delayed, notably in subjects who presented a mild or asymptomatic infection. Many unsolved questions are still pending, notably concerning the protective efficacy of this humoral answer and its duration, together with its role in the pathophysiology of severe infections.